Seit 2004 unterhält das Regionalmuseum eine wissenschaftliche Präsenzbibliothek mit gegenwärtig 7.500 Werken. Gesammelt werden Bücher, Kunstkataloge, Broschüren und zeitschriften mit bezig zum Markgräflerland. Das älteste Exemplar aus der sogenannten "Badischen Bibliothek" der Familie Blankenhorn ist das "Stafforter Buch" von 1599.